Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JtbO88824 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JtbO88824 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JtbO88824 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JtbO88824 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JtbO88824 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JtbO88824 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JtbO88824 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JtbO88824 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JtbO88824 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JtbO88824 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JtbO88824 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JtbO88824 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JtbO88824 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
JtbO88824 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JtbO88824 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
JtbO88824 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JtbO88824 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JtbO88824 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JtbO88824 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JtbO88824 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JtbO88824 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
JtbO88824 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JtbO88824 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JtbO88824 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JtbO88824 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JtbO88824 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JtbO88824 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JtbO88824 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JtbO88824 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JtbO88824 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JtbO88824 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JtbO88824 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JtbO88824 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JtbO88824 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JtbO88824 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JtbO88824 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JtbO88824 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JtbO88824 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JtbO88824 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JtbO88824 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JtbO88824 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JtbO88824 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JtbO88824 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JtbO88824 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JtbO88824 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JtbO88824 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JtbO88824 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JtbO88824 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JtbO88824 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JtbO88824 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
JtbO88824 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JtbO88824 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JtbO88824 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JtbO88824 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
JtbO88824 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JtbO88824 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JtbO88824 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JtbO88824 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JtbO88824 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JtbO88824 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JtbO88824 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JtbO88824 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JtbO88824 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JtbO88824 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JtbO88824 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JtbO88824 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JtbO88824 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JtbO88824 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JtbO88824 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JtbO88824 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JtbO88824 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JtbO88824 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JtbO88824 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JtbO88824 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JtbO88824 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
JtbO88824 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JtbO88824 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JtbO88824 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JtbO88824 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
JtbO88824 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JtbO88824 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JtbO88824 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JtbO88824 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
JtbO88824 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
JtbO88824 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
JtbO88824 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
JtbO88824 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
JtbO88824 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
JtbO88824 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
JtbO88824 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JtbO88824 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JtbO88824 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
JtbO88824 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JtbO88824 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JtbO88824 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JtbO88824 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JtbO88824 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JtbO88824 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JtbO88824 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms