Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tom1O88746 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tom1O88746 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tom1O88746 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tom1O88746 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tom1O88746 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tom1O88746 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tom1O88746 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tom1O88746 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tom1O88746 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tom1O88746 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tom1O88746 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tom1O88746 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tom1O88746 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tom1O88746 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tom1O88746 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tom1O88746 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tom1O88746 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tom1O88746 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms