Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms