Protein–RNA interactions for Protein: O88665

Brd7, Bromodomain-containing protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd7O88665 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd7O88665 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd7O88665 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd7O88665 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd7O88665 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd7O88665 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd7O88665 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd7O88665 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd7O88665 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms