Protein–RNA interactions for Protein: O88572

Lrp6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp6O88572 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrp6O88572 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrp6O88572 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrp6O88572 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrp6O88572 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms