Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns1O88456 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns1O88456 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns1O88456 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns1O88456 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns1O88456 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Capns1O88456 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Capns1O88456 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns1O88456 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns1O88456 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns1O88456 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns1O88456 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns1O88456 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns1O88456 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns1O88456 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns1O88456 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns1O88456 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns1O88456 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns1O88456 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns1O88456 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns1O88456 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns1O88456 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns1O88456 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns1O88456 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns1O88456 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns1O88456 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns1O88456 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns1O88456 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capns1O88456 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capns1O88456 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capns1O88456 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capns1O88456 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capns1O88456 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms