Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtssO70370 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtssO70370 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtssO70370 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtssO70370 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtssO70370 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtssO70370 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtssO70370 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtssO70370 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtssO70370 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtssO70370 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtssO70370 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtssO70370 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtssO70370 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtssO70370 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtssO70370 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtssO70370 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtssO70370 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CtssO70370 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtssO70370 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtssO70370 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CtssO70370 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtssO70370 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtssO70370 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtssO70370 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtssO70370 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtssO70370 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CtssO70370 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtssO70370 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtssO70370 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtssO70370 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtssO70370 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtssO70370 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtssO70370 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtssO70370 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtssO70370 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtssO70370 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtssO70370 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtssO70370 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtssO70370 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtssO70370 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtssO70370 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtssO70370 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtssO70370 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtssO70370 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtssO70370 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtssO70370 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtssO70370 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtssO70370 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtssO70370 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CtssO70370 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CtssO70370 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtssO70370 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtssO70370 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtssO70370 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtssO70370 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtssO70370 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtssO70370 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtssO70370 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtssO70370 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtssO70370 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtssO70370 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtssO70370 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtssO70370 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtssO70370 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtssO70370 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtssO70370 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtssO70370 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtssO70370 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtssO70370 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtssO70370 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CtssO70370 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CtssO70370 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtssO70370 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtssO70370 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtssO70370 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtssO70370 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtssO70370 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtssO70370 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtssO70370 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtssO70370 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtssO70370 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CtssO70370 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtssO70370 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtssO70370 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtssO70370 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CtssO70370 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtssO70370 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtssO70370 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtssO70370 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CtssO70370 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtssO70370 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtssO70370 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CtssO70370 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtssO70370 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtssO70370 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtssO70370 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtssO70370 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtssO70370 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtssO70370 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms