Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChadO55226 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChadO55226 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChadO55226 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChadO55226 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChadO55226 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChadO55226 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChadO55226 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ChadO55226 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChadO55226 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChadO55226 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChadO55226 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChadO55226 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChadO55226 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChadO55226 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChadO55226 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChadO55226 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ChadO55226 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChadO55226 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ChadO55226 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChadO55226 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChadO55226 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChadO55226 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChadO55226 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChadO55226 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChadO55226 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChadO55226 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChadO55226 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChadO55226 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChadO55226 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChadO55226 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ChadO55226 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChadO55226 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChadO55226 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChadO55226 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChadO55226 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChadO55226 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChadO55226 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChadO55226 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChadO55226 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChadO55226 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChadO55226 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChadO55226 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChadO55226 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChadO55226 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChadO55226 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ChadO55226 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChadO55226 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChadO55226 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChadO55226 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChadO55226 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChadO55226 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChadO55226 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChadO55226 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChadO55226 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChadO55226 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChadO55226 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChadO55226 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChadO55226 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChadO55226 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChadO55226 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChadO55226 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChadO55226 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChadO55226 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChadO55226 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChadO55226 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChadO55226 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChadO55226 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChadO55226 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChadO55226 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChadO55226 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChadO55226 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChadO55226 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChadO55226 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChadO55226 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChadO55226 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChadO55226 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChadO55226 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChadO55226 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChadO55226 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChadO55226 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChadO55226 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChadO55226 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChadO55226 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChadO55226 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChadO55226 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChadO55226 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChadO55226 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChadO55226 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChadO55226 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChadO55226 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChadO55226 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChadO55226 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChadO55226 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChadO55226 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChadO55226 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChadO55226 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChadO55226 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChadO55226 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChadO55226 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms