Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FiglaO55208 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FiglaO55208 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FiglaO55208 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FiglaO55208 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FiglaO55208 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FiglaO55208 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms