Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms