Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mmp10O55123 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms