Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrxO55103 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrxO55103 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrxO55103 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrxO55103 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrxO55103 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrxO55103 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrxO55103 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrxO55103 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrxO55103 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrxO55103 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrxO55103 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrxO55103 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrxO55103 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrxO55103 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrxO55103 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
PrxO55103 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrxO55103 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrxO55103 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrxO55103 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrxO55103 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrxO55103 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrxO55103 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrxO55103 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrxO55103 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrxO55103 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrxO55103 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrxO55103 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrxO55103 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrxO55103 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrxO55103 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrxO55103 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrxO55103 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrxO55103 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrxO55103 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrxO55103 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrxO55103 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrxO55103 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrxO55103 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrxO55103 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrxO55103 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrxO55103 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PrxO55103 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrxO55103 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrxO55103 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrxO55103 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrxO55103 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrxO55103 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrxO55103 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrxO55103 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrxO55103 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrxO55103 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrxO55103 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrxO55103 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrxO55103 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrxO55103 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrxO55103 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PrxO55103 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrxO55103 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrxO55103 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrxO55103 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrxO55103 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrxO55103 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrxO55103 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrxO55103 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrxO55103 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrxO55103 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrxO55103 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrxO55103 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrxO55103 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrxO55103 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrxO55103 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrxO55103 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrxO55103 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrxO55103 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrxO55103 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrxO55103 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrxO55103 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PrxO55103 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PrxO55103 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PrxO55103 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrxO55103 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrxO55103 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrxO55103 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrxO55103 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrxO55103 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrxO55103 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrxO55103 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrxO55103 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrxO55103 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrxO55103 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrxO55103 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrxO55103 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrxO55103 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrxO55103 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrxO55103 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrxO55103 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrxO55103 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrxO55103 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrxO55103 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms