Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syngr1O55100 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms