Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1bO55017 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1bO55017 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms