Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms