Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SlkO54988 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SlkO54988 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SlkO54988 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SlkO54988 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SlkO54988 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SlkO54988 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SlkO54988 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SlkO54988 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SlkO54988 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SlkO54988 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SlkO54988 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SlkO54988 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SlkO54988 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SlkO54988 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SlkO54988 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SlkO54988 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SlkO54988 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SlkO54988 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SlkO54988 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SlkO54988 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SlkO54988 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SlkO54988 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SlkO54988 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SlkO54988 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SlkO54988 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SlkO54988 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SlkO54988 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SlkO54988 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SlkO54988 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SlkO54988 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SlkO54988 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SlkO54988 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SlkO54988 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SlkO54988 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SlkO54988 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SlkO54988 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SlkO54988 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SlkO54988 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SlkO54988 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SlkO54988 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SlkO54988 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SlkO54988 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SlkO54988 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SlkO54988 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SlkO54988 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SlkO54988 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SlkO54988 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SlkO54988 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SlkO54988 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SlkO54988 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SlkO54988 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SlkO54988 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SlkO54988 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SlkO54988 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SlkO54988 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SlkO54988 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SlkO54988 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SlkO54988 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SlkO54988 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SlkO54988 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SlkO54988 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SlkO54988 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SlkO54988 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SlkO54988 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SlkO54988 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SlkO54988 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SlkO54988 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SlkO54988 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SlkO54988 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SlkO54988 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SlkO54988 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SlkO54988 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SlkO54988 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SlkO54988 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SlkO54988 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SlkO54988 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SlkO54988 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SlkO54988 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SlkO54988 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SlkO54988 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SlkO54988 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SlkO54988 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SlkO54988 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SlkO54988 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SlkO54988 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SlkO54988 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SlkO54988 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SlkO54988 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SlkO54988 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SlkO54988 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SlkO54988 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SlkO54988 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SlkO54988 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SlkO54988 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SlkO54988 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SlkO54988 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SlkO54988 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SlkO54988 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SlkO54988 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms