Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema6bO54951 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sema6bO54951 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms