Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NlkO54949 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NlkO54949 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NlkO54949 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NlkO54949 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NlkO54949 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NlkO54949 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NlkO54949 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NlkO54949 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NlkO54949 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NlkO54949 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NlkO54949 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NlkO54949 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NlkO54949 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NlkO54949 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NlkO54949 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NlkO54949 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NlkO54949 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NlkO54949 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NlkO54949 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NlkO54949 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NlkO54949 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NlkO54949 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NlkO54949 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NlkO54949 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NlkO54949 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NlkO54949 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NlkO54949 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NlkO54949 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NlkO54949 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NlkO54949 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NlkO54949 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NlkO54949 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NlkO54949 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NlkO54949 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NlkO54949 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NlkO54949 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NlkO54949 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NlkO54949 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NlkO54949 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NlkO54949 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NlkO54949 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NlkO54949 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NlkO54949 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NlkO54949 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NlkO54949 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NlkO54949 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NlkO54949 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NlkO54949 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NlkO54949 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NlkO54949 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NlkO54949 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NlkO54949 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NlkO54949 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NlkO54949 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NlkO54949 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NlkO54949 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NlkO54949 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NlkO54949 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NlkO54949 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NlkO54949 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NlkO54949 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NlkO54949 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NlkO54949 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NlkO54949 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NlkO54949 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NlkO54949 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NlkO54949 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NlkO54949 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NlkO54949 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NlkO54949 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NlkO54949 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NlkO54949 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NlkO54949 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NlkO54949 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NlkO54949 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NlkO54949 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NlkO54949 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NlkO54949 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NlkO54949 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NlkO54949 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NlkO54949 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NlkO54949 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NlkO54949 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NlkO54949 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NlkO54949 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NlkO54949 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NlkO54949 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NlkO54949 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NlkO54949 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NlkO54949 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NlkO54949 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NlkO54949 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NlkO54949 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NlkO54949 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NlkO54949 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NlkO54949 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NlkO54949 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NlkO54949 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NlkO54949 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms