Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms