Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TsksO54887 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TsksO54887 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TsksO54887 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TsksO54887 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TsksO54887 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TsksO54887 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TsksO54887 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TsksO54887 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TsksO54887 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TsksO54887 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TsksO54887 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TsksO54887 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TsksO54887 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TsksO54887 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TsksO54887 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TsksO54887 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TsksO54887 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TsksO54887 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TsksO54887 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TsksO54887 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TsksO54887 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TsksO54887 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TsksO54887 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TsksO54887 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TsksO54887 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TsksO54887 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TsksO54887 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TsksO54887 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TsksO54887 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TsksO54887 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TsksO54887 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TsksO54887 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TsksO54887 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TsksO54887 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TsksO54887 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TsksO54887 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TsksO54887 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TsksO54887 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TsksO54887 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TsksO54887 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TsksO54887 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TsksO54887 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TsksO54887 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TsksO54887 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TsksO54887 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TsksO54887 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TsksO54887 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TsksO54887 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TsksO54887 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TsksO54887 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TsksO54887 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TsksO54887 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TsksO54887 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TsksO54887 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TsksO54887 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TsksO54887 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TsksO54887 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TsksO54887 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TsksO54887 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TsksO54887 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TsksO54887 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TsksO54887 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TsksO54887 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TsksO54887 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TsksO54887 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TsksO54887 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TsksO54887 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TsksO54887 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TsksO54887 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TsksO54887 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TsksO54887 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TsksO54887 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TsksO54887 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TsksO54887 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TsksO54887 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TsksO54887 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TsksO54887 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TsksO54887 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TsksO54887 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TsksO54887 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TsksO54887 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TsksO54887 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TsksO54887 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TsksO54887 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TsksO54887 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TsksO54887 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TsksO54887 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TsksO54887 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TsksO54887 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TsksO54887 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TsksO54887 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TsksO54887 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TsksO54887 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TsksO54887 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TsksO54887 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TsksO54887 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TsksO54887 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TsksO54887 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TsksO54887 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms