Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Limk2O54785 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Limk2O54785 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limk2O54785 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limk2O54785 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Limk2O54785 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limk2O54785 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms