Protein–RNA interactions for Protein: O35972

Mrpl23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl23O35972 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl23O35972 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms