Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FxnO35943 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FxnO35943 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FxnO35943 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FxnO35943 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FxnO35943 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FxnO35943 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FxnO35943 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FxnO35943 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FxnO35943 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FxnO35943 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FxnO35943 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FxnO35943 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FxnO35943 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FxnO35943 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FxnO35943 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FxnO35943 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FxnO35943 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FxnO35943 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FxnO35943 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FxnO35943 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FxnO35943 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FxnO35943 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FxnO35943 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FxnO35943 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FxnO35943 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FxnO35943 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FxnO35943 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FxnO35943 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FxnO35943 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FxnO35943 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FxnO35943 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FxnO35943 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FxnO35943 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FxnO35943 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FxnO35943 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FxnO35943 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FxnO35943 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FxnO35943 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FxnO35943 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FxnO35943 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FxnO35943 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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FxnO35943 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FxnO35943 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FxnO35943 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FxnO35943 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FxnO35943 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FxnO35943 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FxnO35943 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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FxnO35943 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FxnO35943 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FxnO35943 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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FxnO35943 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FxnO35943 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FxnO35943 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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FxnO35943 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FxnO35943 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FxnO35943 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FxnO35943 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FxnO35943 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FxnO35943 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FxnO35943 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FxnO35943 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FxnO35943 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FxnO35943 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FxnO35943 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FxnO35943 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FxnO35943 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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FxnO35943 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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