Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms