Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PnnO35691 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PnnO35691 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PnnO35691 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PnnO35691 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PnnO35691 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PnnO35691 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PnnO35691 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PnnO35691 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PnnO35691 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PnnO35691 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PnnO35691 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PnnO35691 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PnnO35691 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PnnO35691 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PnnO35691 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PnnO35691 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PnnO35691 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PnnO35691 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PnnO35691 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PnnO35691 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PnnO35691 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PnnO35691 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PnnO35691 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PnnO35691 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PnnO35691 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PnnO35691 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PnnO35691 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PnnO35691 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PnnO35691 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PnnO35691 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PnnO35691 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PnnO35691 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PnnO35691 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PnnO35691 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PnnO35691 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PnnO35691 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PnnO35691 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PnnO35691 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PnnO35691 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PnnO35691 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PnnO35691 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PnnO35691 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PnnO35691 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PnnO35691 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PnnO35691 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PnnO35691 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PnnO35691 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PnnO35691 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PnnO35691 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PnnO35691 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PnnO35691 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PnnO35691 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PnnO35691 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PnnO35691 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PnnO35691 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PnnO35691 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PnnO35691 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PnnO35691 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PnnO35691 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PnnO35691 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PnnO35691 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PnnO35691 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PnnO35691 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PnnO35691 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PnnO35691 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PnnO35691 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PnnO35691 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PnnO35691 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PnnO35691 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PnnO35691 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PnnO35691 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PnnO35691 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PnnO35691 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PnnO35691 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PnnO35691 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PnnO35691 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PnnO35691 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PnnO35691 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PnnO35691 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PnnO35691 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PnnO35691 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PnnO35691 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PnnO35691 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PnnO35691 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PnnO35691 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PnnO35691 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PnnO35691 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PnnO35691 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PnnO35691 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PnnO35691 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PnnO35691 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PnnO35691 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PnnO35691 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PnnO35691 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PnnO35691 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PnnO35691 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PnnO35691 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PnnO35691 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PnnO35691 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms