Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Prrt1O35449 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Prrt1O35449 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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