Protein–RNA interactions for Protein: O35448

Ppt2, Lysosomal thioesterase PPT2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt2O35448 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppt2O35448 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppt2O35448 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms