Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-ObO35424 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms