Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppef2O35385 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppef2O35385 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppef2O35385 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppef2O35385 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppef2O35385 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppef2O35385 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppef2O35385 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppef2O35385 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppef2O35385 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms