Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Abcc1O35379 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abcc1O35379 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Abcc1O35379 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Abcc1O35379 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abcc1O35379 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abcc1O35379 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abcc1O35379 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Abcc1O35379 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abcc1O35379 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abcc1O35379 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abcc1O35379 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abcc1O35379 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms