Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d1bO35324 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms