Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Scarb2O35114 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms