Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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