Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ncoa3O09000 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ncoa3O09000 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms