Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn1O08788 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms