Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MttpO08601 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MttpO08601 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MttpO08601 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MttpO08601 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MttpO08601 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MttpO08601 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MttpO08601 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MttpO08601 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MttpO08601 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MttpO08601 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MttpO08601 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MttpO08601 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MttpO08601 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MttpO08601 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MttpO08601 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MttpO08601 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MttpO08601 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MttpO08601 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MttpO08601 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MttpO08601 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MttpO08601 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MttpO08601 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MttpO08601 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MttpO08601 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MttpO08601 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MttpO08601 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MttpO08601 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MttpO08601 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MttpO08601 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MttpO08601 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MttpO08601 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MttpO08601 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MttpO08601 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MttpO08601 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MttpO08601 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MttpO08601 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MttpO08601 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MttpO08601 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MttpO08601 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MttpO08601 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MttpO08601 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MttpO08601 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MttpO08601 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MttpO08601 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MttpO08601 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MttpO08601 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MttpO08601 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MttpO08601 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MttpO08601 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MttpO08601 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MttpO08601 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MttpO08601 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MttpO08601 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MttpO08601 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MttpO08601 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MttpO08601 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MttpO08601 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MttpO08601 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MttpO08601 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MttpO08601 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MttpO08601 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MttpO08601 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MttpO08601 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MttpO08601 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MttpO08601 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MttpO08601 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MttpO08601 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MttpO08601 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MttpO08601 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MttpO08601 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MttpO08601 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MttpO08601 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MttpO08601 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MttpO08601 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MttpO08601 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MttpO08601 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MttpO08601 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MttpO08601 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MttpO08601 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MttpO08601 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MttpO08601 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MttpO08601 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MttpO08601 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MttpO08601 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MttpO08601 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MttpO08601 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MttpO08601 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MttpO08601 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MttpO08601 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MttpO08601 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MttpO08601 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MttpO08601 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MttpO08601 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MttpO08601 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MttpO08601 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MttpO08601 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MttpO08601 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MttpO08601 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MttpO08601 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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