Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8050L7N2E3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8050L7N2E3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8050L7N2E3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8050L7N2E3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8050L7N2E3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8050L7N2E3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8050L7N2E3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8050L7N2E3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8050L7N2E3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8050L7N2E3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8050L7N2E3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8050L7N2E3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8050L7N2E3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms