Protein–RNA interactions for Protein: J3QPA5

Gm3099, Predicted gene 3099, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3099J3QPA5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3099J3QPA5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms