Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Gm21900J3QP38 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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