Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms