Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21976J3QNN2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21976J3QNN2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21976J3QNN2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21976J3QNN2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21976J3QNN2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21976J3QNN2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21976J3QNN2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gm21976J3QNN2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21976J3QNN2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21976J3QNN2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21976J3QNN2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gm21976J3QNN2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21976J3QNN2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21976J3QNN2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gm21976J3QNN2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21976J3QNN2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21976J3QNN2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21976J3QNN2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21976J3QNN2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21976J3QNN2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gm21976J3QNN2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Gm21976J3QNN2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21976J3QNN2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Gm21976J3QNN2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21976J3QNN2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Gm21976J3QNN2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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Gm21976J3QNN2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Gm21976J3QNN2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Gm21976J3QNN2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21976J3QNN2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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