Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm20918J3QN17 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm20918J3QN17 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm20918J3QN17 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm20918J3QN17 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm20918J3QN17 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm20918J3QN17 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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