Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3336J3QMQ6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3336J3QMQ6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3336J3QMQ6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3336J3QMQ6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3336J3QMQ6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3336J3QMQ6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3336J3QMQ6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3336J3QMQ6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3336J3QMQ6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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