Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20834J3QM72 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms