Protein–RNA interactions for Protein: G3XA57

Rab11fip2, Rab11 family-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip2G3XA57 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip2G3XA57 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip2G3XA57 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms