Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms