Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pcf11G3X9Z4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pcf11G3X9Z4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms