Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pnmal2G3X9N3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms