Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms