Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nccrp1G3X9C2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms